Los servicios hidrológicos de los ecosistemas forestales son aquellos relacionados con las diversas formas en que los bosques afectan los flujos de agua en la biosfera. Entre ellos podemos mencionar la regulación del régimen hídrico, el mantenimiento o mejora de la calidad del agua, el control de la erosión y sedimentación, la reducción de la salinización en los suelos, la infiltración y percolación de agua en el suelo y sub-suelo y el mantenimiento de los hábitat acuáticos.

La conservación de los bosques, a través de mecanismos de mercado para servicios hidrológicos, es un tema de especial interés para FONAM. Las características de estos servicios y su gestión dependerán fuertemente de las características intrínsecas de cada sitio, así como del perfil y las necesidades de los beneficiarios.